Item type |
デフォルトアイテムタイプ(フル)(1) |
公開日 |
2020-06-30 |
タイトル |
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タイトル |
Sequence Analysis of a Total of Three Megabases of DNA in Two Regions of Chromosome 8p |
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言語 |
en |
作成者 |
Isomura, Minoru
Ikegawa, Shiro
Kinjo, Takao
Takeuchi, Kumiko
Yamane-Tanaka, Yuka
Kitami, Kikuko
Nakamura, Yusuke
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アクセス権 |
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アクセス権 |
open access |
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アクセス権URI |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
主題 |
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言語 |
en |
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主題Scheme |
Other |
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主題 |
large-scale DNA sequencing |
主題 |
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言語 |
en |
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主題Scheme |
Other |
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主題 |
physical and transcriptional maps |
主題 |
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言語 |
en |
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主題Scheme |
Other |
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主題 |
human chromosome 8p11.2 |
主題 |
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言語 |
ja |
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主題Scheme |
Other |
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主題 |
human chromosome 8p22→p21.3 |
内容記述 |
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内容記述タイプ |
Other |
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内容記述 |
Large-scale sequencing of genomic regions and in silico gene trapping together represent a highly efficient and powerful approach for identifying novel genes. We performed megabase-level sequence analyses of two genomic regions on human chromosome 8p (8p11.2 and 8p22.→p21.3), after covering those segments with sequence-ready contigs composed of 74 cosmids, 14 BACs, and three PAC clones. We determined continuous nucleotide sequences of 1,856,753 bases on 8p11.2 and 1,210,381 bases on 8p22→p21.3 by combining the shotgun and primer-walking methods. In silico gene trapping identified four novel genes in the 8p11.2 region and, in the 8p22→p21.3 region, six known genes ( PRLTS, PCM1, MTMR7, HCAT2, HFREP-1 and PHP ) and three novel genes. The distribution of Alu and LINE1 repetitive elements and the densities of predicted exons were different in each region, and Alu -rich portions contained more exonic sequences than LINE1-rich areas. |
内容記述 |
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内容記述タイプ |
Other |
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内容記述 |
論文 |
出版者 |
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言語 |
en |
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出版者 |
Oxford University Press |
言語 |
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言語 |
eng |
資源タイプ |
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資源タイプ |
journal article |
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資源タイプ識別子 |
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 |
出版タイプ |
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出版タイプ |
VoR |
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出版タイプResource |
http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 |
識別子 |
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識別子 |
http://hdl.handle.net/20.500.12000/46345 |
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識別子タイプ |
HDL |
関連情報 |
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識別子タイプ |
DOI |
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関連識別子 |
https://doi.org/10.1093/dnares/6.6.387 |
関連情報 |
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識別子タイプ |
DOI |
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関連識別子 |
https://doi.org/10.1093/dnares/6.6.387 |
収録物識別子 |
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収録物識別子タイプ |
ISSN |
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収録物識別子 |
1340-2838 |
収録物識別子 |
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収録物識別子タイプ |
ISSN |
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収録物識別子 |
1756-1663 |
収録物名 |
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言語 |
en |
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収録物名 |
DNA Research |
書誌情報 |
巻 6,
号 6,
p. 387-400,
発行日 1999-12-01
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